使用化肥的劣势：

1.化肥由于缺乏有机质和腐殖质，土壤团粒结构遭到破坏，导致土壤板结，农业和作物产量下降。

2.化肥的大量使用降低了蔬菜和水果的质量。因为农作物不仅需要氮、磷、钾，还需要钙、铁、锌、硒等多种微量元素。而且化肥一般成分比较单一，长期使用化肥会导致土壤中养分含量单一，容易导致作物营养失衡，从而阻碍作物内部的转化和合成，导致作物品质下降，瓜不甜，菜不香。

3.化肥的大量使用也导致土壤中的有益菌和蚯蚓大量死亡。

4.长期低效施用化肥，往往导致土壤中某些元素过量积累，土壤理化性质发生变化，造成环境污染。

5.从现在化肥的大量使用来看，化肥用得越多，地利优势越低，我们越依赖化肥，形成恶性循环。

生物菌肥的优势：

1.改良土壤。(1)通过有益菌的大量繁殖，大量有益菌在植物根部周围形成优势种群，降低其他有害菌的生命活动。(2)分解土壤有机质，促进土壤团粒的形成，通过有益菌的活动疏松土壤，使土壤的保肥、供肥、保水、供水、透气得到良好的调节。(3)分解土壤中的农药残留，以免农药对下一茬作物造成伤害。它还能分解植物生长过程中通过根部排出的有害物质。

2.固氮、解磷、解钾的功能。空气中的一部分氮可以通过有益菌的生长代谢产生相应的酶和酸，分解土壤中难溶性的磷钾肥从而成为植物可以吸收的磷钾肥。因此，可以大大提高作物对肥料的利用率，减少肥料的施用量。

3.提高作物质量。解磷、解钾的同时，能促进土壤中微量元素的释放，被作物利用。同时，有益菌代谢产生植物所需的多种物质，如小分子氨基酸、促生长物质、维生素等。4.达到生物防病害的效果，灌根可以控制土壤中的病菌，喷洒在叶片上，防病害的入侵。

4.促进作物早熟，延长收获期。因为改良了土壤的理化性质，土壤养分丰富均衡，土壤中的肥料能更好地被作物吸收，所以能促进作物早熟，延长收获期。

5.与有机肥配合使用，可以持续改良土壤，2-3年土壤可以达到生产有机作物的标准。而且由于有益菌能快速分解有机物供作物吸收，克服了有机肥肥效慢、单施有机肥产量低的特点。