1.提供完整且相对协调的营养。

有机肥料中都含有作物生长所需的养分和有益元素。此外，他们主要元素量比例均匀，有利于作物吸收利用。因此，某些营养元素的比例失调不会因为大量增加有机肥的施用而失衡，破坏土壤营养平衡，造成肥力下降等负面影响。相反，有机肥施用越多，土壤营养元素越平衡，越有利于作物吸收和利用养分。

2.促进土壤微生物的生长和作物的吸收利用。有机肥含有大量的有机质，是各种微生物生长繁殖的场所。有机肥料的有机质在分解过程中，还能产生各种酚、维生素、酶、生长素，促进作物根系的生长和养分的吸收。

3.增加土壤替代量，提高作物保肥能力。所有有机肥料都有很强的阳离子替代能力，能吸收更多的钾、铵、镁，锌等营养元素可以防止淋失，提高土壤肥力，特别是一些腐植质酸类有机肥效果更明显。此外，有机肥料还具有很强的缓冲能力，可以防止长期施用化肥引起的酸度变化影响作物生长，提高土壤本身的抗逆性，保证作物生长，保证土壤生态环境良好。

4.减少养分固定，提高养分利用率。有机肥含有多种有机酸、腐殖酸等羟基物质，都具有很强的螯合能力，能与多种金属元素螯合形成螯合物，防止土壤固定这些营养元素而失效。如有机肥与磷肥、有机肥的混合使用，有机肥中有机酸等螯合物能螯合土壤中高活性的铝离子，并能阻止铝磷结合形成农作物难以吸收的闭蓄态磷，从而大大改良土壤有效磷含量。

5.加速土壤团聚体的形成，改善土壤的物理性质。有机肥施入土壤后，分解过程中的有机胶体物质能与土壤中的无机胶体物质结合。形成不同粒径的有机-无机团聚体。有机无机团聚体是土壤肥料的重要指标。含的越多，土壤的物理性质越好，保土、保水、保肥能力越强，通气性能越好，作物根系越发达。

6.增加作物产量，提高农产品质量。在营养元素相同的情况下，有机肥与化肥相比。用作基肥时，有机肥比化肥好。作为追肥施用时，全腐熟有机肥的效果往往好于化肥。尤其是提高农产品质量比化肥更有利。有机肥含有大量植物所需的养分，对植物的养分供应相对温和长久，后效长。有机肥也含有各种微量元素。因为有机肥中的各种营养元素比较齐全，而且这些物质完全是无毒无害的天然物质，这是一个高产的好办法，为绿色食品提供了所需条件。有机肥在土壤中分解转化成各种腐殖酸物质。它能促进植物体内的酶活性、物质合成、运输和积累。腐殖酸是一种高分子物质，阳离子取代度高，络合吸附性能好，对重金属离子有很好的络合吸附效果，能有效减轻重金属离子毒害作物，阻止它们进入植物体内。这对生产无公害、卫生的绿色食品有利。